Una volta installato il server FTP, il passo successivo è di creare la struttura di directory richiesta nella directory principale del server FTP. WebSphere Partner Gateway richiede una particolare struttura di directory in modo tale che i componenti del Destinatario e del Gestore documenti possono correttamente identificare il partecipante che invia il documento in entrata. La struttura è descritta in Figura 15.
Ciascuna directory del partecipante contiene una directory Binary e una directory Documents. Entrambe le directory contengono una Directory Production e una directory Test.
La directory dei documenti viene utilizzata quando un partecipante invia un documento XML che contiene le informazioni di instradamento complete (utilizzando l'FTP) in un hub. E' necessaria la creazione di una definizione XML personalizzata.
La directory Binaria viene utilizzata quando un partecipante invia altri documenti (utilizzando l'FTP) nell'hub.
Per ogni partecipante che utilizza l'FTP per inviare e ricevere i documenti, creare le seguenti cartelle dalla directory root del server FTP: