Una definizione di flusso di documenti è formata al minimo, di un pacchetto, di un protocollo e di un flusso di documenti. Le definizioni di flusso di documenti specificano i tipi di documenti che verranno elaborati da WebSphere Partner Gateway.
L'impacchettamento fa riferimento alla logica richiesta per assemblare un documento secondo una specifica, come ad esempio, AS2. Un flusso di protocollo è la logica richiesta per elaborare un documento che aderisce ad un certo protocollo, come ad esempio, EDI-X12. Un flusso di documenti descrive come deve essere il documento.
Nelle sezioni successive vengono illustrati i passaggi, in generale, per l'impostazione di un flusso di documenti tra Gestore comunità ed un partecipante. Inoltre, in queste sezioni vengono descritti i punti in cui è possibile impostare gli attributi.