È possibile utilizzare il file system di WebSphere Partner Gateway - Express per trasferire i messaggi da e verso le applicazioni enterprise, incluso WebSphere Partner Gateway Enterprise, su una rete esistente. Le directory dei messaggi si trovano nella directory EXPRESS_HOME/data/FileSystemAdapter2/partners. Su un sistema che esegue i5/OS o OS/400, la directory EXPRESS_HOME è /QIBM/UserData/WSPGExpress60. La directory "partners" contiene una directory secondaria denominata per ciascun partner configurato nel sistema. La struttura delle directory dovrebbe assomigliare alla seguente:
EXPRESS_HOME
data
FileSystemAdapter2
partners
partner1
partner2
...
partnerX
Se si desidera inviare un messaggio ad un partner, ad esempio, "partner1", spostare il messaggio nella directory secondaria "send" appropriata della directory "partner1". Ogni partner dispone di un gruppo di directory che conservano i messaggi inviati, da inviare, ricevuti e che hanno dato errore. Ogni directory send contiene una directory secondaria che corrisponde al metodo di invio e al contenuto inviato. Ad esempio, "partner1" dell'esempio precedente ha le seguenti directory secondarie:
partner1
error
rec_err
received
send
sent
La directory secondaria "error" contiene i messaggi la cui trasmissione ha avuto esito negativo. La directory secondaria "rec_err" contiene i messaggi la cui ricezione non è riuscita. La directory secondaria "received" contiene i messaggi ricevuti con esito positivo. La directory secondaria "send" contiene i messaggi che in quel momento sono in fase di invio. La directory secondaria "sent" contiene i messaggi inviati con esito positivo. Ognuna delle precedenti directory secondarie contiene il proprio gruppo di directory secondarie uguali. Le directory secondarie esistono per identificare il tipo di contenuto ed il protocollo di messaggistica utilizzato nell'invio dei messaggi. Ognuna delle precedenti directory ha la seguente struttura di directory secondarie:
AS2
binary
EDI-Consent
EDIFACT
EDI-X12
MDN
XML
HTTP
Le directory secondarie della directory AS2 vengono utilizzate per inviare e ricevere messaggi AS2. La directory secondaria "binary" raccoglie i messaggi binary. "EDI-Consent", "EDIFACT" e "EDI-X12" sono per i messaggi in formato EDI. La directory secondaria MDN raccoglie le conferme ricezione ricevute; non viene utilizzata nella struttura ad albero della directory "send". La directory "XML" contiene i messaggi XML arbitrari.
La directory HTTP contiene i messaggi inviati o ricevuti utilizzando il metodo POST HTTP.