E' possibile utilizzare ESB separati per differenti settori in un'organizzazione o per separare le funzioni di verifica e di produzione.
Questi ESB possono essere utilizzati separatamente oppure è possibile collegarli per consentire l'inoltro dei messaggi tra i bus.
Un collegamento simile consente di associare WebSphere ESB con una rete WebSphere MQ esistente per integrare i backbone di messaggistica esistenti.