O desenvolvedor de integração define o processamento necessário para uma mensagem conforme ela flui do solicitante para o serviço, selecionando e conectando fisicamente as primitivas de mediação umas às outras).
No WebSphere Integration Developer, um depurador visual permite que o desenvolvedor de integração depure os fluxos de mediação, com pontos de interrupção, etapas e inspeções únicas dos campos de mensagens, conforme elas fluem através da mediação.
Em seguida, os módulos são empacotados em um arquivo EAR (Enterprise Archive) padrão do WebSphere. Um arquivo EAR contém todos os arquivos necessários para implementar o aplicativo.