Un server autonomo ha la propria console di gestione, è pienamente operativo ed è gestito indipendentemente da tutti gli altri server. È possibile utilizzarlo da solo o associarlo ad una cella di gestori distribuzione dalla console di gestione del gestore distribuzione o con il comando addNode. Il server non può essere eseguito quando ne si effettua l'associazione. È possibile associare un profilo autonomo di WebSphere Process Server solo se non vi sono altri profili associati.
È possibile distribuire le soluzioni ad un server autonomo. Se si sceglie di installare la galleria di Applicazioni di esempio (o si sceglie un'installazione completa), è possibile esplorare la soluzione distribuita sul server autonomo. Ciascun server autonomo ha una console Primi passi. Il server autonomo viene definito dal profilo server autonomo.
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