Un pagamento manuale è un pagamento a un intestatario del caso, che viene emesso al di fuori del sistema, ovvero, quando il sistema è offline. Se per qualsiasi motivo il sistema non è disponibile e viene emesso un pagamento a una persona, le informazioni relative a questo pagamento manuale possono essere acquisite sul sistema.
L'acquisizione del pagamento manuale richiama i processi che ricreano tutti gli elementi di un pagamento inclusi lo strumento di pagamento, l'istruzione di pagamento, gli elementi riga di istruzione raggruppati e qualsiasi elemento riga di istruzione di detrazione/fiscale.
Una volta creati gli elementi finanziari del pagamento manuale, il sistema elabora il pagamento in scadenza così che il pagamento non venga versato una seconda volta. Il sistema confronta quindi l'importo del pagamento manuale con l'importo del pagamento elaborato e crea un pagamento in eccesso o insufficiente per rettificare la differenza. Inoltre viene inviata un'attività di notifica al proprietario del caso per notificare che si è verificato un pagamento in eccesso o insufficiente.