Un pagamento emesso per errore può essere annullato. L'annullamento di un pagamento indica che un pagamento non è stato ricevuto. Ad esempio, un pagamento può essere annullato se un partecipante indica che un assegno, inviato per posta, si è perso. Un pagamento viene annullato a livello di istruzione di pagamento. Quando un'istruzione di pagamento viene annullata, lo stato dell'istruzione di pagamento cambia da "emesso" a "annullato". Vengono annullati anche tutti gli elementi riga di istruzione all'interno dell'istruzione di pagamento e il loro stato cambia da "elaborato" a "annullato".
È possibile che un pagamento venga annullato perché il conto bancario è stato chiuso o un errore nei dettagli strumento potrebbe richiedere l'annullamento del pagamento. Quando un pagamento viene annullato, viene registrato il motivo dell'annullamento del pagamento. Con la cancellazione l'istruzione di pagamento viene negata anziché eliminata dal sistema. Tale operazione viene effettuata per motivi di contabilità e tracciabilità. Una nuova istruzione di revoca viene creata per annullare l'importo dell'istruzione di pagamento. Un elemento riga di istruzione di revoca viene anche creato per ogni elemento riga di istruzione raggruppato nell'istruzione di pagamento.
Qualsiasi pagamento annullato può essere riemesso all'intestatario originale o a un intestatario alternativo. Ad esempio, un pagamento di un assegno che è stato perso può essere riemesso all'intestatario originale. I pagamenti possono essere riemessi utilizzando qualsiasi modello di distribuzione attivo dell'intestatario. Ad esempio, un pagamento originale emesso tramite assegno può essere riemesso quotidianamente mediante contanti.
Quando un pagamento viene riemesso, una nuova istruzione di pagamento e gli elementi riga di pagamento vengono creati. L'istruzione di pagamento annullato e i relativi elementi riga di istruzione hanno lo stato "annullato". La nuova istruzione di pagamento ha lo stato "emesso" e i nuovi elementi riga di istruzione di pagamento hanno lo stato "elaborato". Un pagamento può essere riemesso durante il processo di annullamento o dopo che l'istruzione di pagamento è stata annullata.