Los Service Packs y parches de emergencia deben poder mover, reestructurar o sobrescribir sin problemas los archivos de aplicación. Si modifica estos archivos, los Service Packs o parches de emergencia pueden sobrescribirlos sin aviso. No hay ninguna garantía de que estos cambios sean compatibles con las modificaciones que ha realizado, por lo que podría ser que no fuera posible volver a aplicar los cambios de sustitución posteriormente.
Existe un número muy reducido de excepciones a esta regla y éstas se listan a continuación: