Η εφαρμογή των πινάκων βάσεων δεδομένων γίνεται μετά τη δημιουργία των βάσεων δεδομένων του WebSphere Business Monitor από το παράθυρο εκκίνησης. Κατά τη φάση της εφαρμογής, το Schema Generator δημιουργεί τα αντικείμενα μοντελοποίησης που θα εφαρμοστούν για την ολοκλήρωση της ρύθμισης των βάσεων δεδομένων. Στη συνέχεια οι βάσεις δεδομένων είναι έτοιμες να συμπληρωθούν με δεδομένα.