Prima di installare WebSphere ESB è necessario essere a conoscenza dei problemi di compatibilità con altri prodotti WebSphere.
WebSphere ESB può essere installato sulla stessa stazione di lavoro come qualsiasi versione di WebSphere Application Server. È possibile installare WebSphere ESB separatamente o, se si ha WebSphere Application Server Versione 6.1 o Versione 6.2 installato, è possibile estenderlo per ottenere la capability WebSphere ESB.