È possibile utilizzare il workbench per sviluppare procedure memorizzate Java che dipendono da classi nei file JAR diversi dal file JAR in cui viene distribuita la procedura memorizzata. Questa funzionalità è supportata per i file JAR e per le procedure memorizzate Java che hanno come destinazione un server DB2 per z/OS Versione 9.
È possibile importare un file JAR in un progetto di sviluppo dati per consentire a questo tipo di procedura memorizzata Java di eseguire compilazioni e pacchetti localmente. Dal workbench è inoltre possibile distribuire o rilasciare un file JAR da un server di database e visualizzare le proprietà dei file JAR in Esplora datatabase.