Quando você instala o Configuration Manager, o caminho para o diretório contendo o binário Java a ser utilizado para ativar a interface gráfica com o usuário é incluído no arquivo ce_install_path/tools/configure/configmgr.ini.
-vm C:\Program Files\IBM\FileNet\ContentEngine\_cejvm\bin
-vm /opt/IBM/FileNet/ContentEngine/_cejvm/bin