Data Warehouse Center peut stocker des données dans toute base de données de la famille DB2, y compris DB2 Universal Database pour AS/400 et DB2 Universal Database pour OS/390, ainsi que dans des fichiers à plat. Il peut également être utilisé pour alimenter une vaste gamme de bases de données par l'intermédiaire de DB2 DataJoiner, le logiciel de compatibilité avec les bases de données tierces développé par IBM.

Pour peupler les tables qui forment l'entrepôt, Data Warehouse Center extrait des données d'une ou plusieurs sources d'entrepôt (tables, vues ou fichiers), puis les transfère vers le système d'entrepôt et les transforme lors de leur insertion dans une table d'entrepôt.