Dependendo do aplicativo que você está executando, existem dois motivos para isso:
Se você estiver executando o scanadf, a origem será definida como Single Page.
Se você estiver executando o XSane, o ADF Modus (localizado na janela de configuração do XSane) será definido como Multiple Pages, mas a definição de origem (localizada na janela principal do XSane) será definida como Single Page.
Se você estiver executando o scanadf, digite:
; ou
Se você estiver executando o XSane:
Na janela principal do XSane, escolha Multiple Pages no menu suspenso ao lado do ícone do scanner.